RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 FCGR1AP12314 374 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 IDO1P14902 403 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CD1DP15813 335 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 LBPP18428 481 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TACR2P21452 398 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 IL10P22301 178 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 OR1G1P47890 313 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TTPAP49638 278 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 STC1P52823 247 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 THOP1P52888 689 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CCL23P55773 120 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 FPGSQ05932 587 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 EFEMP1Q12805 493 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CEACAM7Q14002 265 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CRY1Q16526 586 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PCSK7Q16549 785 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 SMU1Q2TAY7 513 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 AGKQ53H12 422 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 SFT2D3Q587I9 215 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ANKS6Q68DC2 871 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TTC23LQ6PF05 361 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 BORAQ6PGQ7 559 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 SPATA24Q86W54 205 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MIER2Q8N344 545 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PSMG2Q969U7 264 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PLD4Q96BZ4 506 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TMEM209Q96SK2 561 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 SEMA3CQ99985 751 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MGME1Q9BQP7 344 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 EBF3Q9H4W6 596 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 RIC8BQ9NVN3 520 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ARMC1Q9NVT9 282 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ADA2Q9NZK5 511 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 GMIPQ9P107 970 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CD300AQ9UGN4 299 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MAFFQ9ULX9 164 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.5□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 E2F8A0AVK6 867 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 H7C0S8 307 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 J3KR12 359 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 MRASO14807 208 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 KLK8O60259 260 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 VPS26AO75436 327 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 NDUFS3O75489 264 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 BAIAP3O94812 1187 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 FAM58BPP0C7Q3 252 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 HSD17B1P14061 328 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 ABCG1P45844 678 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 RGS19P49795 217 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 RABGGTBP53611 331 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PKNOX1P55347 436 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 DSC2Q02487 901 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 GNA12Q03113 381 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 TAF10Q12962 218 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 LCP2Q13094 533 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 INPP5AQ14642 412 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 RPS6KA2Q15349 733 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 USP41Q3LFD5 358 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 UNC50Q53HI1 259 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 LPCAT4Q643R3 524 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 REP15Q6BDI9 236 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 CERS6Q6ZMG9 384 aa8.49□□□□□ -1.05
ACTB-208ENST00000464611 DHFR2Q86XF0 187 aa8.49□□□□□ -1.05
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