RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DLDP09622 509 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 STAT5AP42229 794 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PGDP52209 483 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ST8SIA6P61647 398 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 IL13RA1P78552 427 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP3CAQ08209 521 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MGAT2Q10469 447 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAM9Q13443 819 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CALCRLQ16602 461 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PGS1Q32NB8 556 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NADK2Q4G0N4 442 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 VASNQ6EMK4 673 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CHST9Q7L1S5 443 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 RD3Q7Z3Z2 195 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM69Q86WT6 500 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NUP93Q8N1F7 819 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 STARD8Q92502 1023 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ALG3Q92685 438 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CENPTQ96BT3 561 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PCED1BQ96HM7 432 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 KIRREL1Q96J84 757 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SOX7Q9BT81 388 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ELOVL4Q9GZR5 314 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ASB7Q9H672 318 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CHST11Q9NPF2 352 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 KCND1Q9NSA2 647 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 COPG2Q9UBF2 871 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TLK1Q9UKI8 766 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CDH9Q9ULB4 789 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CA5BQ9Y2D0 317 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF510Q9Y2H8 683 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LRP4O75096 1905 aa4.12□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A1W2PQM1 296 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC154A6NI56 674 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PMM2O15305 246 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC7A4O43246 635 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRTM2O43300 516 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HCRTO43612 131 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM189A1O60320 539 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 RAD1O60671 282 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ZG16O60844 167 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP6R2O75170 966 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM127O75204 238 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LRCH4O75427 683 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MED24O75448 989 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 UBXN7O94888 489 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CSF2P04141 144 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ANXA6P08133 673 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 KLK2P20151 261 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 AKT2P31751 481 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TXKP42681 527 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMD8P48556 350 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LIG4P49917 911 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NEK3P51956 506 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PMS2P54278 862 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL7P80098 99 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DSC2Q02487 901 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ART3Q13508 389 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SEMA5AQ13591 1074 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PHF19Q5T6S3 580 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PARGQ86W56 976 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT78Q8N1N4 520 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 AADATQ8N5Z0 425 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ERMNQ8TAM6 284 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.6 ms