RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453553.1

USP25-206, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 3

Gene USP25, Length 611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-206ENST00000453553 OLIG2Q13516 323 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 FHL1Q13642 323 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 IRF3Q14653 427 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ALG11Q2TAA5 492 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 DLK2Q6UY11 383 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 CHST9Q7L1S5 443 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 SNX32Q86XE0 403 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ZBTB2Q8N680 514 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 POMGNT1Q8WZA1 660 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 SMARCE1Q969G3 411 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 FAM149B1Q96BN6 582 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 LYZL4Q96KX0 146 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 SPATA17Q96L03 361 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 WACQ9BTA9 647 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 STRA6Q9BX79 667 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 SH2D4AQ9H788 454 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 SCPEP1Q9HB40 452 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 MORF4L1Q9UBU8 362 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 WNT16Q9UBV4 365 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 CEPT1Q9Y6K0 416 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 FAM169AQ9Y6X4 670 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 A0A1W2PRG0 241 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 TMEM202A6NGA9 273 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 PAGE4O60829 102 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ENTPD3O75355 529 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 SERPINI2O75830 405 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 PRSS2P07478 247 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 OAS2P29728 719 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 THBS3P49746 956 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 COMPP49747 757 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 KRT83P78385 493 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 SORDQ00796 357 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 DPCR1Q3MIW9 517 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 RAB41Q5JT25 222 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 C1orf141Q5JVX7 400 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 TSSK4Q6SA08 328 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 MTSS1LQ765P7 747 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 HAPLN4Q86UW8 402 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 WDR63Q8IWG1 891 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 PHF21BQ96EK2 531 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 TXNDC15Q96J42 360 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 SLC41A2Q96JW4 573 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ADPGKQ9BRR6 497 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 BTBD18B2RXH4 712 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ZIC3O60481 467 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 PPP5CP53041 499 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 UBXN2AP68543 259 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 PRAMEP78395 509 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 EGR4Q05215 589 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 TRAF3Q13114 568 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 NAE1Q13564 534 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 KRT24Q2M2I5 525 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 USP41Q3LFD5 358 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ANKRD54Q6NXT1 300 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 FJX1Q86VR8 437 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ELP5Q8TE02 316 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ZNF479Q96JC4 524 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 ZPBPQ9BS86 351 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-206ENST00000453553 APOL6Q9BWW8 343 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms