RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TPRG1LQ5T0D9 272 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 LIPNQ5VXI9 398 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 STEAP3Q658P3 488 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 LRRN1Q6UXK5 716 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ADGRF2Q8IZF7 708 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 OR56B2PQ8NGI1 322 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 UFD1Q92890 307 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PPM1MQ96MI6 270 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FAM20AQ96MK3 541 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 OPALINQ96PE5 141 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 HOXD1Q9GZZ0 328 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PIF1Q9H611 641 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 COMMD9Q9P000 198 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MIOXQ9UGB7 285 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ENOPH1Q9UHY7 261 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 BOLA1Q9Y3E2 137 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CEPT1Q9Y6K0 416 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF536O15090 1300 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 A0A087X0B3 334 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 E9PAM4 449 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RGS13O14921 159 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SSX4O60224 188 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RLN2P04090 185 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RXRAP19793 462 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TAC1P20366 129 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CDH4P55283 916 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ALX1Q15699 326 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 GALNTL6Q49A17 601 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 AKAP4Q5JQC9 854 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PCID2Q5JVF3 399 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FAM46CQ5VWP2 391 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 DESI1Q6ICB0 168 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R18Q6NYC8 613 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 BRAT1Q6PJG6 821 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB33Q86T24 672 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 GPR65Q8IYL9 337 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RCOR2Q8IZ40 523 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SCML4Q8N228 414 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TM9SF4Q92544 642 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TTC9Q92623 222 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 APBB2Q92870 758 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PI4K2AQ9BTU6 479 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 IFT27Q9BW83 186 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 GANQ9H2C0 597 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ITM2CQ9NQX7 267 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TAS2R7Q9NYW3 318 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CACNG2Q9Y698 323 aa5.59□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM210A6NLX4 147 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SOBPA7XYQ1 873 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 F6X3S4 739 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 SLC28A1O00337 649 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RFPL3O75679 317 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 NDST3O95803 873 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ALAS1P13196 640 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 BGNP21810 368 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 HTR2AP28223 471 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 LIFRP42702 1097 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CYP2J2P51589 502 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CASP6P55212 293 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ACTR2P61160 394 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CHRNA2Q15822 529 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP7Q16829 419 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 IMPG1Q17R60 797 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 PDXDC2PQ6P474 469 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 ASRGL1Q7L266 308 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CARFQ8N187 725 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FBXL6Q8N531 539 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 TAAR8Q969N4 342 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 RNFT2Q96EX2 444 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 LRCH3Q96II8 777 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 CEP41Q9BYV8 373 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-209ENST00000442510 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
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