RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNJ5P48544 419 aa4.61□□□□□ -1.67
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RPS3AP54-201ENST00000435535 AP3M2P53677 418 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUCB2P80303 420 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FMO1Q01740 532 aa4.61□□□□□ -1.67
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RPS3AP54-201ENST00000435535 HS1BP3Q53T59 392 aa4.6□□□□□ -1.67
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RPS3AP54-201ENST00000435535 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.6□□□□□ -1.67
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RPS3AP54-201ENST00000435535 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KBTBD6Q86V97 674 aa4.6□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.6□□□□□ -1.67
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