RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 GANQ9H2C0 597 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 STARD5Q9NSY2 213 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 DKK3Q9UBP4 350 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 PISDQ9UG56 409 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXD8-202ENST00000429017 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.59□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TSPAN11A1L157 253 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM202A6NGA9 273 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TOR1BO14657 336 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 EPHB6O15197 1021 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PRAMEF10O60809 474 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RASGRP1O95267 797 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PCCBP05166 539 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FAM87AP0C7U9 286 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 UCHL3P15374 230 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ETFBP38117 255 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PTPN9P43378 593 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PEX5P50542 639 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RHOAP61586 193 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 NFATC4Q14934 902 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC14Q15048 493 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ELOCQ15369 112 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 USP53Q70EK8 1073 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 STRADAQ7RTN6 431 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 HOMEZQ8IX15 550 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 USP7Q93009 1102 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SGF29Q96ES7 293 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PDFQ9HBH1 243 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FGF22Q9HCT0 170 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM51Q9NW97 253 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 IL17BQ9UHF5 180 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.58□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 J3KR12 359 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 GFPT2O94808 682 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 IGSF6O95976 241 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FUCA1P04066 466 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ALPIP09923 528 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LIPCP11150 499 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CTSEP14091 401 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ACPPP15309 386 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SDC4P31431 198 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MMP12P39900 470 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LIG3P49916 1009 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CSRP3P50461 194 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 B4GALNT1Q00973 533 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CDR2Q01850 454 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RALGDSQ12967 914 aa6.58□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 SERINC3Q13530 473 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CLCA4Q14CN2 919 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TBR1Q16650 682 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 UGP2Q16851 508 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 C16orf46Q6P387 395 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 WDR59Q6PJI9 974 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PAOXQ6QHF9 649 aa6.58□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CCNJLQ8IV13 435 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PMEPA1Q969W9 287 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 NTAN1Q96AB6 310 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 WDR92Q96MX6 357 aa6.58□□□□□ -1.36
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