RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 CMKLR1Q99788 373 aa20.92■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 CDH19Q9H159 772 aa20.92■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 LIPCP11150 499 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 HGFP14210 728 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 CTPS1P17812 591 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 CA4P22748 312 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 GPR3P46089 330 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 GPR1P46091 355 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 AP2M1Q96CW1 435 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 LYSMD1Q96S90 227 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 ABCG8Q9H221 673 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 ST14Q9Y5Y6 855 aa20.91■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 B4GAT1O43505 415 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 ECEL1O95672 775 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 KRT7P08729 469 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 MX2P20592 715 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 MAN1A1P33908 653 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 ADCY8P40145 1251 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 STC1P52823 247 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 CTBSQ01459 385 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 PTSQ03393 145 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 ITKQ08881 620 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 PTPRRQ15256 657 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 MAP9Q49MG5 647 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 PIM3Q86V86 326 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 NAGSQ8N159 534 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD6Q8NC69 237 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 HDAC11Q96DB2 347 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 PISDQ9UG56 409 aa20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 UNC13CQ8NB66 2214 aa20.89■□□□□ 0.94
LIMS1-208ENST00000428064 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 H2AFZP0C0S5 128 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CD82P27701 267 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CASP14P31944 242 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 EPHB1P54762 984 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 DSC2Q02487 901 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 LRP8Q14114 963 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 IHHQ14623 411 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SLC18A3Q16572 532 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 H2AFVQ71UI9 128 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 JAMLQ86YT9 394 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 COX14Q96I36 57 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 OR2M4Q96R27 311 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 IFNKQ9P0W0 207 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CD84Q9UIB8 345 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF487B1APH4 448 aa20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PRLP01236 227 aa20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ITIH1P19827 911 aa20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 POLD2P49005 469 aa20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R40P59535 323 aa20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SQSTM1Q13501 440 aa20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PQLC3Q8N755 202 aa20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 EXD1Q8NHP7 514 aa20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA6CQ9H3T2 930 aa20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DQB2P05538 268 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 TPM3P06753 285 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 GJC1P36383 396 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 OR1D5P58170 312 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 GBE1Q04446 702 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PYCR3Q53H96 274 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PHF19Q5T6S3 580 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF605Q86T29 641 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 VSIG1Q86XK7 387 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SCAMP4Q969E2 229 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 RDH14Q9HBH5 336 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 DTLQ9NZJ0 730 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms