RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.89■□□□□ 0.3
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MMP20O60882 483 aa16.89■□□□□ 0.29
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.88■□□□□ 0.29
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PFDN6O15212 129 aa16.88■□□□□ 0.29
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ITGA9Q13797 1035 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF284Q2VY69 593 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP7D1Q3KQU3 841 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX20Q7Z614 316 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRP8Q86W28 1048 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCF12Q99081 682 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAFAH2Q99487 392 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGAP2Q99490 1192 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 CPNE1Q99829 537 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF180Q9UJW8 692 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYO10Q9HD67 2058 aa16.87■□□□□ 0.29
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa16.87■□□□□ 0.29
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D3LB9A6J9 549 aa16.87■□□□□ 0.29
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CDH16O75309 829 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 SASH3O75995 380 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 INHBAP08476 426 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D3HP0C7X1 549 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 GM2AP17900 193 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPTQ07507 201 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFATC2Q13469 925 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.298e-8■■■■□ 20.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP85LQ5SZL2 805 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM151BQ6UXP7 276 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 CERS6Q6ZMG9 384 aa16.87■□□□□ 0.29
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM124AQ86V42 546 aa16.87■□□□□ 0.29
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