RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 IPPQ9Y573 584 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6AP2O75787 350 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SNAP29O95721 258 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CRHBPP24387 322 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ADORA2BP29275 332 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IREB2P48200 963 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CD47Q08722 323 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC10A7Q0GE19 358 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PIANPQ8IYJ0 282 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM210AQ96ND0 272 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPKQ9BS16 269 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CXorf21Q9HAI6 301 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa3.63□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IQCA1LA6NCM1 817 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MGEA5O60502 916 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KPNA6O60684 536 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C1RP00736 705 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RGRP47804 291 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RELAQ04206 551 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC12A1Q13621 1099 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SELPLGQ14242 412 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FSCBQ5H9T9 825 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 REP15Q6BDI9 236 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD23Q86SG2 305 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO1HQ8N1T3 1032 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AGR3Q8TD06 166 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RILPQ96NA2 401 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM14Q96QK8 99 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPV6Q9H1D0 765 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GREM1O60565 184 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SHMT2P34897 504 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPA13P48723 471 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ECT2LQ008S8 904 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NRF1Q16656 503 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TIGD5Q53EQ6 642 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BSPRYQ5W0U4 402 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CALHM3Q86XJ0 350 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NLGN2Q8NFZ4 835 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T34Q8NGX1 318 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T3Q8NH03 318 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TCF12Q99081 682 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SPAG4Q9NPE6 437 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HACD3Q9P035 362 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAF6Q9Y4K3 522 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FZD6O60353 706 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GJB3O75712 270 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CNTN5O94779 1100 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF12O95522 483 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RECKO95980 971 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TGM1P22735 817 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MERTKQ12866 999 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 E2F2Q14209 437 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ALFQ53S48 1182 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC6AQ6EIG7 209 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PIM3Q86V86 326 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BRI3BPQ8WY22 251 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDKL2Q92772 493 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MROQ9BYG7 248 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SMPD4Q9NXE4 827 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PCTPQ9UKL6 214 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF25A6NGN4 478 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NEMP1O14524 444 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EI24O14681 340 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MRASO14807 208 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TIPRLO75663 272 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPA4LO95757 839 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 STC1P52823 247 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NME5P56597 212 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HERVK_113P63132 956 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
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