RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF567Q8N184 647 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC25A45Q8N413 288 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EID2Q8N6I1 236 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAMK1GQ96NX5 476 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC61Q9BV99 259 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RMI1Q9H9A7 625 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WASF3Q9UPY6 502 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTPRBP23467 1997 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRSS38A1L453 326 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 K7ESM1 405 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSMD3O43242 534 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZW10O43264 779 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SIGLEC6O43699 453 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTPS1P17812 591 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBL1P28749 1068 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACTN2P35609 894 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HMGCLP35914 325 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPINT3P49223 89 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WNT3AP56704 352 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTSQ03393 145 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOXC1Q12948 553 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALG11Q2TAA5 492 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KDELC1Q6UW63 502 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C4orf22Q6V702 233 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q6ZVL8 140 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARL10Q8N8L6 244 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AVL9Q8NBF6 648 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LMX1AQ8TE12 382 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RTP4Q96DX8 246 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HIC2Q96JB3 615 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BOCQ9BWV1 1114 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GSDMCQ9BYG8 508 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCG8Q9H221 673 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF711Q9Y462 761 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR1A2Q9Y585 309 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP24Q9UPU5 2620 aa8.54□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLHL33A6NCF5 533 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM38O00635 465 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNN4O15554 427 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SDC3O75056 442 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PMPCBO75439 489 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GCATO75600 419 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCEA3O75764 348 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLDN7O95471 211 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GIMD1P0DJR0 217 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC2A4P14672 509 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PNLIPP16233 465 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LAMB3Q13751 1172 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GALNT3Q14435 633 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IHHQ14623 411 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NR0B2Q15466 257 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC1A5Q15758 541 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCSK7Q16549 785 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDKN3Q16667 212 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PARP6Q2NL67 630 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DENND2CQ68D51 928 aa8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.53□□□□□ -1.04
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