RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 SLC4A1P02730 911 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 LRG1P02750 347 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 FGF4P08620 206 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 HMGCLP35914 325 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 PLK1P53350 603 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 HTRA3P83110 453 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ZXDBP98169 803 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 RAD51Q06609 339 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 GAREM2Q75VX8 874 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 RTL10Q7L3V2 364 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 KCNJ9Q92806 393 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 IL17CQ9P0M4 197 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.12■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 GBF1Q92538 1859 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 SYCE1LA8MT33 242 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 KRT36O76013 467 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 PGLSO95336 258 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 MC4RP32245 332 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 VHLP40337 213 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 PTGER3P43115 390 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 CUL3Q13618 768 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC6Q16204 474 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 UNC50Q53HI1 259 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 LINGO4Q6UY18 593 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 BIRC8Q96P09 236 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.11■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 H0Y3Z8 333 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 VPS26AO75436 327 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ESR1P03372 595 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 JUNP05412 331 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ADH1AP07327 375 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 MTHFD2P13995 350 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 KCNC1P48547 511 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ATP4BP51164 291 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 MTTPP55157 894 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ELMOD1Q8N336 334 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 KYQ8NBH2 561 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 FIBINQ8TAL6 211 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 PHF21BQ96EK2 531 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 MYO19Q96H55 970 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 GCNAQ96QF7 691 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 PKP3Q9Y446 797 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF711Q9Y462 761 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 IRAK3Q9Y616 596 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 KLK8O60259 260 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 KRT34O76011 436 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 CKMP06732 381 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 LINC00271P0C7V0 271 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ITGB8P26012 769 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 AP2B1P63010 937 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 CACNG1Q06432 222 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 PEX6Q13608 980 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 MAPRE2Q15555 327 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ARMC5Q96C12 935 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 SERPINI1Q99574 410 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 ACSS2Q9NR19 701 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 STX16O14662 325 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 TBX10O75333 385 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 SUPT7LO94864 414 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 RAG1P15918 1043 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 EPHB1P54762 984 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 XIAPP98170 497 aa20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SUMO3-204ENST00000411651 SQLEQ14534 574 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms