RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 OGNP20774 298 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 MC4RP32245 332 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CXCL12P48061 93 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ARSDP51689 593 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ADPRHP54922 357 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CREB5Q02930 508 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CACNG1Q06432 222 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ITGA9Q13797 1035 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 RASA2Q15283 850 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF284Q2VY69 593 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ANO7Q6IWH7 933 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 TAOK1Q7L7X3 1001 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 OTUD6BQ8N6M0 293 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 COQ10AQ96MF6 247 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CPNE1Q99829 537 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CCDC162PA2VCL2 907 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 LRRC72A6NJI9 287 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 TM7SF2O76062 418 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 PRAMEF1O95521 474 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 SHBGP04278 402 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 PYGLP06737 847 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 DCNP07585 359 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 MSH2P43246 934 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 TPMTP51580 245 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CLCN5P51795 746 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 TAS2R38P59533 333 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 RPS21P63220 83 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 SEMG2Q02383 582 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 MTAPQ13126 283 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 PTPRCAPQ14761 206 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 GPR33Q49SQ1 333 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 GALNT7Q86SF2 657 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 TDRPQ86YL5 185 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 PPM1NQ8N819 430 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 DTD2Q96FN9 168 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 HHIPQ96QV1 700 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 PAFAH2Q99487 392 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM83DQ9H4H8 585 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 GGT7Q9UJ14 662 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 NFS1Q9Y697 457 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 TMEM221A6NGB7 291 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 M0R296 226 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 RASGRF2O14827 1237 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CDH16O75309 829 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 SRP72O76094 671 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 C1QAP02745 245 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 XIAPP98170 497 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 MAP7D1Q3KQU3 841 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF470Q6ECI4 717 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CERS6Q6ZMG9 384 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 SNX20Q7Z614 316 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 NLRP8Q86W28 1048 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 OR2T34Q8NGX1 318 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC44A1Q8WWI5 657 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ULK4Q96C45 1275 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 NUS1Q96E22 293 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 TCF12Q99081 682 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 IL26Q9NPH9 171 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF446Q9NWS9 450 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 EBF1Q9UH73 591 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 A0A0U1RQS6 177 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 MMP20O60882 483 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CNTFP26441 200 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 FOXN2P32314 431 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 GP5P40197 560 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ETV3P41162 512 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 TTPAP49638 278 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 SERPINB9P50453 376 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 PEX6Q13608 980 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 AGERQ15109 404 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 KRT71Q3SY84 523 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 LGSNQ5TDP6 509 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM151BQ6UXP7 276 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 UNC5BQ8IZJ1 945 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 GPR26Q8NDV2 337 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ASB12Q8WXK4 309 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 SCN8AQ9UQD0 1980 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 A0A0C4DFX4 3053 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms