RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PIP4P1Q86T03 277 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 NAXDQ8IW45 347 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SAP25Q8TEE9 199 aa15.34■□□□□ 0.05
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PGGT1B-202ENST00000379615 TEX101Q9BY14 249 aa15.34■□□□□ 0.05
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PGGT1B-202ENST00000379615 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
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PGGT1B-202ENST00000379615 SAR1BQ9Y6B6 198 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
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PGGT1B-202ENST00000379615 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
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PGGT1B-202ENST00000379615 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PHACTR4Q8IZ21 702 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.32■□□□□ 0.04
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PGGT1B-202ENST00000379615 BRSK1Q8TDC3 778 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 GRK7Q8WTQ7 553 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 HIC2Q96JB3 615 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 APOL2Q9BQE5 337 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ETNK1Q9HBU6 452 aa15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa15.32■□□□□ 0.04
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PGGT1B-202ENST00000379615 CASQ1P31415 396 aa15.31■□□□□ 0.04
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PGGT1B-202ENST00000379615 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
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PGGT1B-202ENST00000379615 ETF1P62495 437 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SEMA5AQ13591 1074 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SPARCL1Q14515 664 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ELOCQ15369 112 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP1B1Q16678 543 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.31■□□□□ 0.04
PGGT1B-202ENST00000379615 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.31■□□□□ 0.04
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