RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366998.4

NEK2-201, Transcript of NIMA related kinase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK2, Length 1,865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2-201ENST00000366998 LAMA3Q16787 3333 aa14.94□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 LINC01565O15544 149 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 HSPA4LO95757 839 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 SEMG2Q02383 582 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 CACNG1Q06432 222 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 LIPMQ5VYY2 423 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 USP45Q70EL2 814 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 C12orf40Q86WS4 652 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ERP27Q96DN0 273 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ABHD8Q96I13 439 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 GDF15Q99988 308 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 KCNK13Q9HB14 408 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 FBXO10Q9UK96 956 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TTC34A8MYJ7 566 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 GPR39O43194 453 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 LIG3P49916 1009 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 XIAPP98170 497 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 PTPRNQ16849 979 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 GDE1Q9NZC3 331 aa14.93□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 CDH23Q9H251 3354 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TMEM114B3SHH9 223 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TARM1B6A8C7 271 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 DLX3O60479 287 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TULP3O75386 442 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 RBP1P09455 135 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 CISD3P0C7P0 127 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 SCTRP47872 440 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 PRKAA2P54646 552 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ZBTB16Q05516 673 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 HYAL1Q12794 435 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 VOPP1Q96AW1 172 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 SORT1Q99523 831 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ACSS2Q9NR19 701 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 HEY2Q9UBP5 337 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 FAM50BQ9Y247 325 aa14.92□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 OR1I1O60431 355 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 PRAMEF1O95521 474 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ASLP04424 464 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TFEBP19484 476 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ARRB2P32121 409 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 SLC26A3P40879 764 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 AQP5P55064 265 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ST8SIA6P61647 398 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ASPHQ12797 758 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ACAP2Q15057 778 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 SCRN2Q96FV2 425 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ALG9Q9H6U8 611 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 PNPOQ9NVS9 261 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 WASH3PC4AMC7 463 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 MYO1CO00159 1063 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 BPIP17213 487 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ITGALP20701 1170 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 SUOXP51687 545 aa14.91□□□□□ -0.02
NEK2-201ENST00000366998 NAGLUP54802 743 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms