RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 H0YC42 278 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SYN3O14994 580 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SUV39H1O43463 412 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 LIMK2P53671 638 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NID2Q14112 1375 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 DNTTP04053 509 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PBX3P40426 434 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TFAP2BQ92481 460 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SNX27Q96L92 541 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GVM2 712 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ACSL4O60488 711 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 UGT2B15P54855 530 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PEX6Q13608 980 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KCNA10Q16322 511 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEH1Q9H213 219 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 OR10H3O60404 316 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 STK16O75716 305 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 XIAPP98170 497 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 GNA12Q03113 381 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SLC1A5Q15758 541 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PCED1BQ96HM7 432 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC28BQ9BUN5 200 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NAT16Q8N8M0 369 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TBATAQ96M53 351 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TSSK3Q96PN8 268 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.23■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MATN3O15232 486 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NBNO60934 754 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-DQA2P01906 255 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 S100A13Q99584 98 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC11Q9NVH1 559 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF24P17028 368 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 UXS1Q8NBZ7 420 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NXNL1Q96CM4 212 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 FNDC11Q9BVV2 318 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 H3BM21 787 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA31D3P0C874 917 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SPAM1P38567 509 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 NEK5Q6P3R8 708 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 FUT10Q6P4F1 479 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD3Q96ES6 412 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 FANCEQ9HB96 536 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ARL8BQ9NVJ2 186 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SSR2P43308 183 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 MAPKAPK2P49137 400 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CPTPQ5TA50 214 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf42Q96LP6 360 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.22■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 GSAPA4D1B5 854 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 TSC22D2O75157 780 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 PGM3O95394 542 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 CLK3P49761 638 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 ELP6Q0PNE2 266 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 SPRYD7Q5W111 196 aa20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCSAP-203ENST00000366687 KRT77Q7Z794 578 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms