RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317623.8

PCNX4-201, Transcript of pecanex 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene PCNX4, Length 17,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-201ENST00000317623 BTRCQ9Y297 605 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 U3KQV3 271 aa6.6□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MSH4O15457 936 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 RPN2P04844 631 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 STARD3Q14849 445 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SSX2Q16385 188 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PWWP2AQ96N64 755 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TRMOQ9BU70 441 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ERVK-7P63135 1459 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 F8VP50 259 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ABCG1P45844 678 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SLC11A2P49281 568 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 A0A0J9YYE9 177 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PSMB4P28070 264 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CEP76Q8TAP6 659 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MKL1Q969V6 931 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CGRRF1Q99675 332 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 GMIPQ9P107 970 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MEMO1Q9Y316 297 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 A0A087X0B3 334 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TNNI3P19429 210 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PPATQ06203 517 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 RPTNQ6XPR3 784 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 DAW1Q8N136 415 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 HLA-DQA2P01906 255 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CDKL1Q00532 357 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 RNF6Q9Y252 685 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 LAMC1P11047 1609 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 FSCN2O14926 492 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ORC1Q13415 861 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SNX27Q96L92 541 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SLC7A8Q9UHI5 535 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF3P17036 446 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 KCNA6P17658 529 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 KCTD7Q96MP8 289 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SSX3Q99909 188 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 PKP2Q99959 881 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ULK1O75385 1050 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 BANPQ8N9N5 519 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF607Q96SK3 696 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 HMBSP08397 361 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 HLFQ16534 295 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 SV2AQ7L0J3 742 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CEP41Q9BYV8 373 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 IFNGP01579 166 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 CBX5P45973 191 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.59□□□□□ -1.35
PCNX4-201ENST00000317623 M0R233 179 aa6.59□□□□□ -1.36
PCNX4-201ENST00000317623 NOBOXO60393 691 aa6.59□□□□□ -1.36
PCNX4-201ENST00000317623 FGRP09769 529 aa6.59□□□□□ -1.36
PCNX4-201ENST00000317623 TUBP50607 506 aa6.59□□□□□ -1.36
PCNX4-201ENST00000317623 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PCNX4-201ENST00000317623 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PCNX4-201ENST00000317623 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.59□□□□□ -1.36
PCNX4-201ENST00000317623 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.36
PCNX4-201ENST00000317623 GRIA2P42262 883 aa6.59□□□□□ -1.36
PCNX4-201ENST00000317623 BCAT1P54687 386 aa6.59□□□□□ -1.36
PCNX4-201ENST00000317623 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms