RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
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HPS6-201ENST00000299238 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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HPS6-201ENST00000299238 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HPS6-201ENST00000299238 FAM156AQ8NDB6 213 aa20.16■□□□□ 0.82
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HPS6-201ENST00000299238 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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HPS6-201ENST00000299238 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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HPS6-201ENST00000299238 RCN3Q96D15 328 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS6-201ENST00000299238 CPQQ9Y646 472 aa20.15■□□□□ 0.82
HPS6-201ENST00000299238 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.14■□□□□ 0.82
HPS6-201ENST00000299238 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa20.14■□□□□ 0.82
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HPS6-201ENST00000299238 HLA-DQB2P05538 268 aa20.14■□□□□ 0.82
HPS6-201ENST00000299238 PTPN2P17706 415 aa20.14■□□□□ 0.82
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HPS6-201ENST00000299238 RABL2BQ9UNT1 228 aa20.14■□□□□ 0.81
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HPS6-201ENST00000299238 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 STMN1P16949 149 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 GEMP55040 296 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PGS1Q32NB8 556 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 AFMIDQ63HM1 303 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 ZFP1Q6P2D0 407 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.13■□□□□ 0.81
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