RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 RBP1P09455 135 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINA4P29622 427 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 KCNC1P48547 511 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 MYLK3Q32MK0 819 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 LSMEM2Q8N112 164 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 BIRC8Q96P09 236 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 DPP7Q9UHL4 492 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 A8MX80 341 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB14O43829 449 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 RHOBTB1O94844 696 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRNQ16849 979 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PTERQ96BW5 349 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 COG4Q9H9E3 785 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 RAP2CQ9Y3L5 183 aa22.69■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN7O95471 211 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 KRT16P08779 473 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CD1DP15813 335 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 TTPAP49638 278 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ECT2LQ008S8 904 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CDKN3Q16667 212 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM215Q68D42 235 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 LRMDAQ9H2I8 198 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 POPDC3Q9HBV1 291 aa22.68■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 A8MT66 165 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC22O60826 627 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 TCF3P15923 654 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SEMG2Q02383 582 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SAMD11Q96NU1 681 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 GALPQ9UBC7 116 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 DIAPH2O60879 1101 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINA6P08185 405 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJB13P59910 316 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 KRT72Q14CN4 511 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PAQR3Q6TCH7 311 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PACS2Q86VP3 889 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 TREML1Q86YW5 311 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK15Q8TD08 544 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 NSL1Q96IY1 281 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 TAS2R13Q9NYV9 303 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 GBF1Q92538 1859 aa22.67■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CAPN8A6NHC0 703 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 H3BMM5 538 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 POU2F2P09086 479 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 WEE1P30291 646 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 NRIP1P48552 1158 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ASPHQ12797 758 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP157Q5JU67 520 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CTSL3PQ5NE16 218 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 FAM91A1Q658Y4 838 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 FAM151BQ6UXP7 276 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 Q6ZVU0 165 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PHF21BQ96EK2 531 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CAPN14A8MX76 684 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 RPL14P50914 215 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CACNG1Q06432 222 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 GEN1Q17RS7 908 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CARD16Q5EG05 197 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 CHST14Q8NCH0 376 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.66■■□□□ 1.22
VSTM4-201ENST00000298454 INPP5DQ92835 1189 aa22.66■■□□□ 1.22
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