RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 INSIG1O15503 277 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 DGKGP49619 791 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 NEDD8Q15843 81 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 OR8H2Q8N162 312 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SERPINA6P08185 405 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SLC9A7Q96T83 725 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SGK2Q9HBY8 427 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PIPSLA2A3N6 862 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ARMC8Q8IUR7 673 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SCAIQ8N9R8 606 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 MECRQ9BV79 373 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CDH19Q9H159 772 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 Q9Y3F1 56 aa20.21■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TRIM38O00635 465 aa20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 SERPINB7O75635 380 aa20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PSMG1O95456 288 aa20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PRAMEF1O95521 474 aa20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 ADSSP30520 456 aa20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CACNA2D1P54289 1103 aa20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 TNK2Q07912 1038 aa20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 MTAPQ13126 283 aa20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 CPT1BQ92523 772 aa20.2■□□□□ 0.83
USP25-202ENST00000285681 PPIBP23284 216 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 LRRC72A6NJI9 287 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 ERN1O75460 977 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 IL10RBQ08334 325 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 BTBD9Q96Q07 612 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 PDE9AO76083 593 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 UNC5CO95185 931 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 BPGMP07738 259 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 ZNF24P17028 368 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 PTSQ03393 145 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 FPGSQ05932 587 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 BNIP2Q12982 314 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 TPGS2Q68CL5 300 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 ZNF567Q8N184 647 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 HERVK_113Q902F9 699 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 PALMDQ9NP74 551 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 CD48P09326 243 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 TAF5Q15542 800 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 GPR21Q99679 349 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 SDCBP2Q9H190 292 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.2■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 AP3D1O14617 1153 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 LCA5LO95447 670 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 BCL10O95999 233 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 FGFR3P22607 806 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 CSNK2BP67870 215 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 C3orf14Q9HBI5 128 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 PER2O15055 1255 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 SLC22A3O75751 556 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 OR6B1O95007 311 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 STK16O75716 305 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 PCCBP05166 539 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 ASPAP45381 313 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 TTC23Q5W5X9 447 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 CXorf56Q9H5V9 222 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 ASB3Q9Y575 518 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 NRP1O14786 923 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 SLC25A12O75746 678 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 MANFP55145 182 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 USP4Q13107 963 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 ZNF607Q96SK3 696 aa20.19■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 RCN3Q96D15 328 aa20.18■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 PNPOQ9NVS9 261 aa20.18■□□□□ 0.82
USP25-202ENST00000285681 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms