RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TM4SF1P30408 202 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 DMPKQ09013 629 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ERICH5Q6P6B1 374 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NETO2Q8NC67 525 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN8A6NHC0 703 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 GRM3Q14832 879 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.11■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ECDO95905 644 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CCNCP24863 283 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 IL12AP29459 219 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 TEX47Q8TBZ9 253 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 MYO19Q96H55 970 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 LRATO95237 230 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ALOX5P09917 674 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 BRCC3P46736 316 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CRY2Q49AN0 593 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 GLYATQ6IB77 296 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA1P01009 418 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ARL2P36404 184 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CAPGP40121 348 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CXCR3P49682 368 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CERS6Q6ZMG9 384 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf40BQ96DE9 158 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CHRAC1Q9NRG0 131 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 H3BNX3 289 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NDST3O95803 873 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CTSEP14091 401 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 RHOQP17081 205 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PTGIRP43119 386 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NXNL1Q96CM4 212 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CHID1Q9BWS9 393 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SQORQ9Y6N5 450 aa21.1■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NADKO95544 446 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DQA2P01906 255 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD5Q9NXV2 234 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NID2Q14112 1375 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 IRGMA1A4Y4 181 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ASGR1P07306 291 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF24P17028 368 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CPTPQ5TA50 214 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CORO1BQ9BR76 489 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2QL1A1L167 161 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PLIN3O60664 434 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CCT3P49368 545 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf127Q8N9H9 656 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ADH1AP07327 375 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35G4P0C7Q5 338 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ETS2P15036 469 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PCSK2P16519 638 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 MYL9P24844 172 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 MAPKAPK2P49137 400 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CAPSLQ8WWF8 208 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 FETUBQ9UGM5 382 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 OGDHLQ9ULD0 1010 aa21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CCNYL3P0C7X3 344 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4F2P78329 520 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4F3Q08477 520 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 PYDC2Q56P42 97 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 OR4K2Q8NGD2 314 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 STYXQ8WUJ0 223 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 LRTM1Q9HBL6 345 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NEK6Q9HC98 313 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 MGRN1O60291 552 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJA2O60884 412 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 CIB1Q99828 191 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 RRAGCQ9HB90 399 aa21.08■□□□□ 0.97
CCSAP-201ENST00000284617 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MED22Q15528 200 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TAF13Q15543 124 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PTCHD4Q6ZW05 846 aa21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TWIST2Q8WVJ9 160 aa21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms