RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 TMBIM4Q9HC24 238 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 E9PAM4 449 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 QSOX1O00391 747 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CBX6O95503 412 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 DNASE1L1P49184 302 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC7A2P52569 658 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 GMFBP60983 142 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ULK3Q6PHR2 472 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 TEX47Q8TBZ9 253 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 TSSK3Q96PN8 268 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ATCAYQ86WG3 371 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF398Q8TD17 642 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 NOD2Q9HC29 1040 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 DIP2BQ9P265 1576 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SLCO1B7G3V0H7 640 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF208O43345 1280 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 UBOX5O94941 541 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ACAP1Q15027 740 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 C1orf94Q6P1W5 598 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 OR52J3Q8NH60 311 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAMTS15Q8TE58 950 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.85□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 FPGTO14772 594 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CLOCKO15516 846 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 LGR5O75473 907 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CALB2P22676 271 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 TLE2Q04725 743 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFA9Q16795 377 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 NPAS4Q8IUM7 802 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 KBTBD2Q8IY47 623 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 HMCESQ96FZ2 354 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 EHD3Q9NZN3 535 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PLAGL1Q9UM63 463 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PTPRUQ92729 1446 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 RFXANKO14593 260 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 NELFEP18615 380 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CCND1P24385 295 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PTPN9P43378 593 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF730Q6ZMV8 503 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CEP295NLQ96MC4 621 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CLCC1Q96S66 551 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 GINS4Q9BRT9 223 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 NOX1Q9Y5S8 564 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A0A0MRY4 1105 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 C22orf31O95567 290 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 IL33O95760 270 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL10P27635 214 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PSEN1P49768 467 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 USP46P62068 366 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MTA1Q13330 715 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CHST4Q8NCG5 386 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 NCSTNQ92542 709 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 APOPT1Q96IL0 206 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SPATA13Q96N96 652 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF510Q9Y2H8 683 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CMPK1P30085 196 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 IRAK1P51617 712 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFRSF10BO14763 440 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 CCNDBP1O95273 360 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 UGT2B15P54855 530 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 MCL1Q07820 350 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 USP4Q13107 963 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 SP140Q13342 867 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 NAB1Q13506 487 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBTB6Q15916 424 aa11.84□□□□□ -0.51
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF549Q6P9A3 640 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms