RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 TKTL2Q9H0I9 626 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 SIT1Q9Y3P8 196 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR33A8MZF0 331 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA4LO95757 839 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL5P46777 297 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 EGFL6Q8IUX8 553 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP52Q8N1V2 620 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 CERS2Q96G23 380 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RY13Q9BPV8 354 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 COG4Q9H9E3 785 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 TMCO1Q9UM00 188 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 MAN2B1O00754 1011 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 TULP3O75386 442 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K6O95382 1288 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 EGFP01133 1207 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 GLDCP23378 1020 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 MGAT1P26572 445 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 HADHAP40939 763 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC11A2P49281 568 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 DLG1Q12959 904 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM196Q5HYL7 178 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 LCA5Q86VQ0 697 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 HPS6Q86YV9 775 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 CPXM2Q8N436 756 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 RDH11Q8TC12 318 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 WDCPQ9H6R7 721 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 RRN3Q9NYV6 651 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PTTG2Q9NZH5 202 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 MARK1Q9P0L2 795 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PAGE1O75459 146 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRNB1P11230 501 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS24P62847 133 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP2R5DQ14738 602 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PDK1Q15118 436 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A13Q5J8X5 152 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 C14orf80Q86SX3 495 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 DDI1Q8WTU0 396 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 DLG3Q92796 817 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 BTN2A3PQ96KV6 586 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 RBBP8Q99708 897 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 SIK2Q9H0K1 926 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX15Q9NRS6 342 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN10Q9UBB4 475 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 RGSL1A5PLK6 1076 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 CREB3O43889 395 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 ERFP50548 548 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC36Q1X8D7 754 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 GRAMD1BQ3KR37 738 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2D4BQ5SQS7 431 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZS52 159 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 ADCY4Q8NFM4 1077 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC40Q9H9A6 602 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 LMAN1LQ9HAT1 526 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 HS3ST4Q9Y661 456 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-201ENST00000246533 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SLCO1B7G3V0H7 640 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM13O60858 407 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 VAV1P15498 845 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 LIMK2P53671 638 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CCINQ13939 588 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 HERC3Q15034 1050 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ARPINQ7Z6K5 226 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA24Q86W54 205 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 PHTF2Q8N3S3 785 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 WFDC5Q8TCV5 224 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 EPAS1Q99814 870 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 LATS1O95835 1130 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 GAS6Q14393 721 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC5BQ8IZJ1 945 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 AHI1Q8N157 1196 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC185Q8N715 623 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 KYQ8NBH2 561 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TCF7L2Q9NQB0 619 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF103O00237 685 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNG3O60359 315 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 F9P00740 461 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TACR2P21452 398 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXC13P31276 330 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ADRM1Q16186 407 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM259Q4ZIN3 620 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms