RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243077.7

LRP1-201, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 14,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-201ENST00000243077 MTHFRP42898 656 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 FOXM1Q08050 763 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 NDUFA9Q16795 377 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 OR2T12Q8NG77 320 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 KAT2BQ92831 832 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CIPCQ9C0C6 399 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PSMB4P28070 264 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 HOXC8P31273 242 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SUSD6Q92537 303 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 RDH12Q96NR8 316 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 NODALQ96S42 347 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.01□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 AQP12BA6NM10 295 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 AQP12AQ8IXF9 295 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ADGRB3O60242 1522 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 VTNP04004 478 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CTSHP09668 335 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 LPCAT1Q8NF37 534 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CLHC1Q8NHS4 586 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 C8GP07360 202 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 NDST2P52849 883 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 DGCR6Q14129 220 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 KLHL26Q53HC5 615 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 TATDN1Q6P1N9 297 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PIGWQ7Z7B1 504 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 DEFB106AQ8N104 65 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SEC16AO15027 2179 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 OR10H2O60403 315 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 FKBP1BP68106 108 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 UGT2B17O75795 530 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 USP17L7P0C7H9 530 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 KIR3DL1P43629 444 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SCRN3Q0VDG4 424 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SLCO6A1Q86UG4 719 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 C1orf21Q9H246 121 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 KLK14Q9P0G3 267 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CLDN11O75508 207 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SCNN1AP37088 669 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 MPP1Q00013 466 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ZNF33AQ06730 810 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 GALNT15Q8N3T1 639 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ZFAND2BQ8WV99 257 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SNX15Q9NRS6 342 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 TBCCD1Q9NVR7 557 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CLIC5Q9NZA1 410 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 TFR2Q9UP52 801 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 A0A1B0GVC2 190 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 XKRYO14609 159 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 AKR1A1P14550 325 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 IGFBP5P24593 272 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 BAIAP2Q9UQB8 552 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 E5RJQ4 531 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 TACSTD2P09758 323 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CD86P42081 329 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 IL18R1Q13478 541 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 BTN2A3PQ96KV6 586 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CLCN3P51790 818 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 HLA-DQA2P01906 255 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 PLIN5Q00G26 463 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SPIBQ01892 262 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 E2F2Q14209 437 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 GCNT6Q5T4J0 391 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 LGI2Q8N0V4 545 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 DISP2A7MBM2 1401 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 CLTCL1P53675 1640 aa9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
LRP1-201ENST00000243077 ARPC4P59998 168 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms