RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 NTHL1P78549 312 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 TAS2R42Q7RTR8 314 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 TREML1Q86YW5 311 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 RIN3Q8TB24 985 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 TLE6Q9H808 572 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 VTI1BQ9UEU0 232 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM50BQ9Y247 325 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 MATN2O00339 956 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PEX6Q13608 980 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 CAMK1Q14012 370 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PTPRNQ16849 979 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 FUT11Q495W5 492 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 DGKKQ5KSL6 1271 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ISCA2Q86U28 154 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PIANPQ8IYJ0 282 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 IRF7Q92985 503 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 TAGLN3Q9UI15 199 aa23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 MYO7AQ13402 2215 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB14O43829 449 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 BNIP3LO60238 219 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 SMIM24O75264 130 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PRAMEF12O95522 483 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PENKP01210 267 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PYGLP06737 847 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 CD1DP15813 335 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGAP8P85298 464 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ACCSLQ4AC99 568 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 LSMEM2Q8N112 164 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PHF21BQ96EK2 531 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 LMLNQ96KR4 655 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 HS3ST2Q9Y278 367 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 GBF1Q92538 1859 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A0J9YYE9 177 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PER2O15055 1255 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ATP6V1G2O95670 118 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 TRBC1P01850 177 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 RIPK1Q13546 671 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 SPHK2Q9NRA0 654 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ZMYM5Q9UJ78 669 aa23.87■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF197O14709 1029 aa23.86■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 VPS26AO75436 327 aa23.86■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNA5P22460 613 aa23.86■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 KDSRQ06136 332 aa23.86■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 CACNG1Q06432 222 aa23.86■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 RAD51Q06609 339 aa23.86■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.86■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 TCF7L2Q9NQB0 619 aa23.86■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa23.86■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGEF15O94989 841 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PKMP14618 531 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 TYRP14679 529 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 AOC1P19801 751 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF77Q15935 545 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 C22orf39Q6P5X5 142 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 RINLQ6ZS11 566 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 STK40Q8N2I9 435 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 TEX9Q8N6V9 391 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 EXT2Q93063 718 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PTERQ96BW5 349 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 GTSE1Q9NYZ3 720 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 NOTCH4Q99466 2003 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 TPBGLP0DKB5 382 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PTGER3P43115 390 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 CPA2P48052 419 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ACAD11Q709F0 780 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 MAPK15Q8TD08 544 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 ING5Q8WYH8 240 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 LINC00597Q9H2U6 94 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PIDD1Q9HB75 910 aa23.85■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.84■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 B2RBV5 119 aa23.84■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 OR1I1O60431 355 aa23.84■■□□□ 1.41
RPUSD1-201ENST00000007264 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms