RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	AIM2	O14862	343 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	MTSS1	O43312	755 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ATE1	O95260	518 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	MYF6	P23409	242 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	EPHA3	P29320	983 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	OR1D2	P34982	312 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	BMX	P51813	675 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	EFEMP1	Q12805	493 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	BMPR2	Q13873	1038 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	OXA1L	Q15070	435 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	PHKG1	Q16816	387 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	PID1	Q7Z2X4	250 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ANKFN1	Q8N957	763 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF558	Q96NG5	402 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	CEP41	Q9BYV8	373 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		15.33	■□□□□ 0.05
BBS1-225	ENST00000630659	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KCNK1	O00180	336 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA0355	O15063	1070 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZBTB14	O43829	449 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	EFCAB14	O75071	495 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SOD2	P04179	222 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RALB	P11234	206 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CSF2RA	P15509	400 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ITGB8	P26012	769 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PTPN3	P26045	913 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEA3	P43357	314 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DEFB103A	P81534	67 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ART3	Q13508	389 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	OGFOD2	Q6N063	350 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF534	Q76KX8	674 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SNX32	Q86XE0	403 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TFAP2C	Q92754	450 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf74	Q96LT6	269 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	WDR41	Q9HAD4	459 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CD320	Q9NPF0	282 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PNPO	Q9NVS9	261 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL3	Q9UH77	587 aa		15.33	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659		E9PAM4	449 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CSH1	P0DML2	217 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CSH2	P0DML3	217 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ATF6	P18850	670 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PSMB4	P28070	264 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC7A1	P30825	629 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NME5	P56597	212 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RHD	Q02161	417 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF33A	Q06730	810 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CEACAM7	Q14002	265 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NRF1	Q16656	503 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARTN	Q5T4W7	220 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MROH9	Q5TGP6	573 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CDKL2	Q92772	493 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	COG4	Q9H9E3	785 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	COPG2	Q9UBF2	871 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MID2	Q9UJV3	735 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		15.32	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GTW7	788 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KRBA1	A5PL33	1030 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659		F5H423	210 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	AREL1	O15033	823 aa		15.31	■□□□□ 0.04

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