RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM74	Q86UV6	250 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF653	Q96CK0	615 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	RNF31	Q96EP0	1072 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PSKH2	Q96QS6	385 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	WISP1	O95388	367 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CPNE6	O95741	557 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PEX11B	O96011	259 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CD1C	P29017	333 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ADCY8	P40145	1251 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	RENBP	P51606	427 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	AP1S1	P61966	158 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CDK3	Q00526	305 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ITK	Q08881	620 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NAGS	Q8N159	534 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	BTBD6	Q96KE9	485 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TEX101	Q9BY14	249 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SDK2	Q58EX2	2172 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078		A8MU76	341 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078		H3BRJ5	948 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	INPP4B	O15327	924 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	MAFK	O60675	156 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	MAP3K6	O95382	1288 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PDHA1	P08559	390 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ITGB6	P18564	788 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	GPR1	P46091	355 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ARSD	P51689	593 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SCAMP4	Q969E2	229 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	DTD2	Q96FN9	168 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	AGAP2	Q99490	1192 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	NT5M	Q9NPB1	228 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	RARA	P10276	462 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CR2	P20023	1033 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ARL4A	P40617	200 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ACTR1B	P42025	376 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	HCAR3	P49019	387 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ACTR1A	P61163	376 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	DTX1	Q86Y01	620 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ART4	Q93070	314 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM159	Q96B96	161 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	ABCG8	Q9H221	673 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078	IL17B	Q9UHF5	180 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PQC6	194 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	PGLS	O95336	258 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	ASMTL	O95671	621 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	EML2	O95834	649 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-262	ENST00000628078	CSF2RB	P32927	897 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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