RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	ASB7	Q9H672	318 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	NMUR1	Q9HB89	426 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	NAGPA	Q9UK23	515 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	SMAP	O00193	183 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	OGT	O15294	1046 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPAN6	O43657	245 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	LDB2	O43679	373 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	AP1G1	O43747	822 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	PRNP	P04156	253 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	SLFN14	P0C7P3	912 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNB1	P14635	433 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	CDC25A	P30304	524 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT9	P35527	623 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	NDST1	P52848	882 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS12	P56730	875 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	GSDMD	P57764	484 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBB3	Q13509	450 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	MYLK3	Q32MK0	819 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC184	Q52MB2	194 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	GHDC	Q8N2G8	530 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	NCOA7	Q8NI08	942 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	WNT2B	Q93097	391 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	BICD1	Q96G01	975 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC114	Q96M63	670 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC138	Q96M89	665 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	MED10	Q9BTT4	135 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	SCML2	Q9UQR0	700 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF103	O00237	685 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	LMX1B	O60663	402 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	IGFBP5	P24593	272 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP5J2	P56134	94 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	MLF1	P58340	268 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	SSPN	Q14714	243 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	IRF4	Q15306	451 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	ADGRF1	Q5T601	910 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	DPH6	Q7L8W6	267 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	CD163	Q86VB7	1156 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TMTC2	Q8N394	836 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TMIE	Q8NEW7	156 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	MRAP	Q8TCY5	172 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TAF4B	Q92750	862 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	REPS1	Q96D71	796 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	SCYL1	Q96KG9	808 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	C9orf72	Q96LT7	481 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	AIFM3	Q96NN9	605 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	LMF1	Q96S06	567 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	MPDZ	O75970	2070 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	PCM1	Q15154	2024 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	SCN2A	Q99250	2005 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	6.18	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM189A1	O60320	539 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJC6	O75061	913 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	RASSF9	O75901	435 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SNAP23-223	ENST00000627440	MTA2	O94776	668 aa		6.18	□□□□□ -1.42

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