RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 CALB1P05937 261 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM228BP0C875 321 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ACTN1P12814 892 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYP11B1P15538 503 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TGM1P22735 817 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MCM3P25205 808 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAN1A1P33908 653 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 THPOP40225 353 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TNFSF9P41273 254 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARHGAP25P42331 645 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 NSFP46459 744 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TAF6P49848 677 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 KLK7P49862 253 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF132P52740 706 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC8A3P57103 927 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 LILRA4P59901 499 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PMS2P11Q13670 270 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYP2A13Q16696 494 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 FBXO47Q5MNV8 452 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 LIN9Q5TKA1 542 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ICE2Q659A1 982 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLAG1Q6DJT9 500 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 JADE1Q6IE81 842 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 C11orf63Q6NUN7 778 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZDHHC24Q6UX98 284 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM108Q6UXF1 575 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ALKAL1Q6UXT8 129 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM228AQ86W67 206 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 EFCAB13Q8IY85 973 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM35BQ8NCS4 154 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYRIPQ8NFW9 859 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC30A5Q8TAD4 765 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 URGCPQ8TCY9 931 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPP2R3CQ969Q6 453 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 LRRC46Q96FV0 321 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 HPDLQ96IR7 371 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CHP1Q99653 195 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 AGPAT1Q99943 283 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 GDF15Q99988 308 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZSWIM1Q9BR11 485 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CRB3Q9BUF7 120 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIM62Q9BVG3 475 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPR88Q9GZN0 384 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 LHX5Q9H2C1 402 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPCSQ9HAB8 311 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 POLD4Q9HCU8 107 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 LZTFL1Q9NQ48 299 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 DPP3Q9NY33 737 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 DKK4Q9UBT3 224 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDC23Q9UJX2 597 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 DNAH12Q6ZR08 3092 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 HTTP42858 3142 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 USP27XA6NNY8 438 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 LACTBL1A8MY62 500 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PIRO00625 290 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 DYNC1I1O14576 645 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 NDC80O14777 642 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRAPPC3O43617 180 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 RGS10O43665 173 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLU7O95391 586 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 VNN1O95497 513 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 ERBB2P04626 1255 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYP1A2P05177 515 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 KRT19P08727 400 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 WEE2P0C1S8 567 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 IQCF3P0C7M6 154 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD39.4-201ENST00000620099 VDRP11473 427 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms