RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600026.5

LTBP4-227, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-227	ENST00000600026	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	LIPI	Q6XZB0	460 aa		21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	IL22	Q9GZX6	179 aa		21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		21.96	■■□□□ 1.11
LTBP4-227	ENST00000600026	AVIL	O75366	819 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	TM7SF2	O76062	418 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	MGAT1	P26572	445 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	ECHS1	P30084	290 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	MAGEA3	P43357	314 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	ARHGEF7	Q14155	803 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	CCDC25	Q86WR0	208 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	LRRC39	Q96DD0	335 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	PWWP2A	Q96N64	755 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	LYSMD1	Q96S90	227 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	TRABD	Q9H4I3	376 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		21.95	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026		A0A0U1RQS6	177 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC31A1	O15431	190 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	PIRT	P0C851	137 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	NUDT1	P36639	197 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	MPL	P40238	635 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	PCID2	Q5JVF3	399 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	ARMC3	Q5W041	872 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	LRRC66	Q68CR7	880 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SYT12	Q8IV01	421 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC6A18	Q96N87	628 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	MYOC	Q99972	504 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	FZD3	Q9NPG1	666 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	RAB21	Q9UL25	225 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	DMTF1	Q9Y222	760 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		21.94	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	MAGEB16	A2A368	324 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	HEATR9	A2RTY3	570 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026		E7ESA3	106 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	CRTAM	O95727	393 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	RET	P07949	1114 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	C1S	P09871	688 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF30	P17039	623 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	GM2A	P17900	193 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	ADRA1D	P25100	572 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	DPP6	P42658	865 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	CBLB	Q13191	982 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SGCG	Q13326	291 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	MTM1	Q13496	603 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SEPT6	Q14141	434 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	POU6F1	Q14863	301 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	CDKN3	Q16667	212 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	DENND2C	Q68D51	928 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	CASC4	Q6P4E1	433 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	ASB12	Q8WXK4	309 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SERAC1	Q96JX3	654 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	RANBP9	Q96S59	729 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SYBU	Q9NX95	663 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	NCDN	Q9UBB6	729 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF711	Q9Y462	761 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		21.93	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	C2orf81	A6NN90	581 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	PSMD11	O00231	422 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	WNT9A	O14904	365 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	HOXD12	P35452	270 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	PDE1B	Q01064	536 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SLMAP	Q14BN4	828 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	MSS51	Q4VC12	460 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		21.92	■■□□□ 1.1
LTBP4-227	ENST00000600026	COQ10A	Q96MF6	247 aa		21.92	■■□□□ 1.1

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