RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SFTPCP11686 197 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CR2P20023 1033 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 POLD2P49005 469 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRRQ15256 657 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 NKAIN2Q5VXU1 208 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 NAGSQ8N159 534 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF599Q96NL3 588 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPSAP2O60256 369 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SOCS5O75159 536 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFAIP3P21580 790 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CTBSQ01459 385 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAF2Q12933 501 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF235Q14590 738 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 NKD1Q969G9 470 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TAAR9Q96RI9 348 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDCD1Q96RS6 583 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC12A9Q9BXP2 914 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 NOD2Q9HC29 1040 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6CA6NDK9 693 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6BA6NDN3 693 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PPM1DO15297 605 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF8O76064 485 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC172P0C7W6 258 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6DP0CG33 693 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 CSF2RBP32927 897 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCY8P40145 1251 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR3P46089 330 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 HCAR3P49019 387 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 LIMK2P53671 638 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 MYL5Q02045 173 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 RAET1GQ6H3X3 334 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZVL8 140 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN33Q86UF1 283 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQ67 120 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PPFIA2O75334 1257 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 LRCH4O75427 683 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 MPSTP25325 297 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 BIRC2Q13490 618 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 DOK6Q6PKX4 331 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 LZTR1Q8N653 840 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4D9Q8NGE8 314 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 MGME1Q9BQP7 344 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A18Q9H1K4 315 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD3B7Q9H2F3 369 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ETNK2Q9NVF9 386 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD5Q9NXV2 234 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM9Q9P0T7 183 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PHTF1Q9UMS5 762 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0U1RQS6 177 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ZW10O43264 779 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 IVLP07476 585 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 THRAP10827 490 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TEAD1P28347 426 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP1A2P50993 1020 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 MAXP61244 160 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 RFLNAQ6ZTI6 216 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 FNIP1Q8TF40 1166 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ART4Q93070 314 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ZWILCHQ9H900 591 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 HECTD1Q9ULT8 2610 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD11O00231 422 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 MAFKO60675 156 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SOD1P00441 154 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT1A3P35503 534 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTR1BP42025 376 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTR1AP61163 376 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 NCAPHQ15003 741 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 AGBL5Q8NDL9 886 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SCRN2Q96FV2 425 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SDK2Q58EX2 2172 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BRJ5 948 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PGLSO95336 258 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP1A3P13637 1013 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 LIFP15018 202 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 CTPS1P17812 591 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 AMPD1P23109 780 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 IL1R2P27930 398 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SQSTM1Q13501 440 aa25.55■■□□□ 1.68
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