RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 RFPL1O75677 317 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 ADCY8P40145 1251 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 MAPK9P45984 424 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 STRADAQ7RTN6 431 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.74■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.74■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF787Q6DD87 383 aa21.73■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.73■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 SEMA7AO75326 666 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 PALMO75781 387 aa21.72■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 TEX101Q9BY14 249 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 ULBP3Q9BZM4 244 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 CASS4Q9NQ75 786 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 TLK1Q9UKI8 766 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 ITPR2Q14571 2701 aa21.71■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 GM2AP17900 193 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 PTPN9P43378 593 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 HDAC4P56524 1084 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 NOMO3P69849 1222 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 CDK3Q00526 305 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXM1Q08050 763 aa21.71■■□□□ 1.07
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CAPNS1-205ENST00000588780 SCNN1BP51168 640 aa21.7■■□□□ 1.06
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CAPNS1-205ENST00000588780 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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CAPNS1-205ENST00000588780 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-205ENST00000588780 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM135Q86UB9 458 aa21.68■■□□□ 1.06
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CAPNS1-205ENST00000588780 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.68■■□□□ 1.06
CAPNS1-205ENST00000588780 SP110Q9HB58 689 aa21.68■■□□□ 1.06
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