RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFA10O95299 355 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LCA5LO95447 670 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MT-CO3P00414 261 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LHCGRP22888 699 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CD86P42081 329 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GPR1P46091 355 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GUSBP11Q6P575 273 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZVL8 140 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 RCOR2Q8IZ40 523 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PIH1D2Q8WWB5 315 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 DTD2Q96FN9 168 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 COQ10AQ96MF6 247 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 GPR34Q9UPC5 381 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB17Q13105 803 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 BIRC2Q13490 618 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PCSK7Q16549 785 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 DOK6Q6PKX4 331 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 NAT6Q93015 286 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 HAUS1Q96CS2 278 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 AP2M1Q96CW1 435 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRM-214ENST00000583153 PDXPQ96GD0 296 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SMIM14Q96QK8 99 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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