RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	DEF6	Q9H4E7	631 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743		A0A087X0T9	212 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743		A0A1W2PQM1	296 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	SYCE3	A1L190	88 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	MATN3	O15232	486 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	NOBOX	O60393	691 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CPNE6	O95741	557 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PEX11B	O96011	259 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	FAM228B	P0C875	321 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CCNC	P24863	283 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	SLC5A2	P31639	672 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CDK3	Q00526	305 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	DPT	Q07507	201 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	TRAF2	Q12933	501 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ODF2	Q5BJF6	829 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743		Q6ZVL8	140 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	SPRED1	Q7Z699	444 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	LUZP1	Q86V48	1076 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PGBD5	Q8N414	524 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	AP2M1	Q96CW1	435 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF670	Q9BS34	389 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PISD	Q9UG56	409 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ITPR1	Q14643	2758 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743		K7ENP7	123 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PRB1	P04280	392 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CEACAM5	P06731	702 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	IVL	P07476	585 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	TCF4	P15884	667 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CD82	P27701	267 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ALDH4A1	P30038	563 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	GJC1	P36383	396 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	GPR3	P46089	330 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PDX1	P52945	283 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	SKOR1	P84550	965 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	NLRP8	Q86W28	1048 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CCNY	Q8ND76	341 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	EXD1	Q8NHP7	514 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	FATE1	Q969F0	183 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	BTBD6	Q96KE9	485 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PROSC	O94903	275 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ASMTL	O95671	621 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	LIPC	P11150	499 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CTPS1	P17812	591 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	GM2A	P17900	193 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	PBX1	P40424	430 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	GALNT2	Q10471	571 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	CLN3	Q13286	438 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	LRP8	Q14114	963 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-208	ENST00000579743	TRIM14	Q14142	442 aa		13.67	□□□□□ -0.22

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