RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PRKCE	Q02156	737 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	STK4	Q13043	487 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PDCL	Q13371	301 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SEC23B	Q15437	767 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CEP170P1	Q96L14	293 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	GPR78	Q96P69	363 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	AZI2	Q9H6S1	392 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	HAS3	O00219	553 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	IRAK2	O43187	625 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	HBP1	O60381	514 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SMC2	O95347	1197 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	RSPH10B	P0C881	870 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	CCL5	P13501	91 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFS1	P28331	727 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	MPG	P29372	298 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SLC8A1	P32418	973 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	HOXD12	P35452	270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SLC26A2	P50443	739 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TAS2R50	P59544	299 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ASIC1	P78348	528 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	MAPK7	Q13164	816 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	DRP2	Q13474	957 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	BIRC3	Q13489	604 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	DAW1	Q8N136	415 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	DPF1	Q92782	380 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	PANK4	Q9NVE7	773 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	ASGR1	P07306	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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