RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ST8SIA5O15466 376 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OIP5O43482 229 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FCER2P06734 321 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GNAO1P09471 354 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CCNA2P20248 432 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FDFT1P37268 417 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OMPP47874 163 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DGKQP52824 942 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 REEP5Q00765 189 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CAMK2DQ13557 499 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 UBXN11Q5T124 520 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RTL10Q7L3V2 364 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CCNJLQ8IV13 435 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CORO2AQ92828 525 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 VPS33AQ96AX1 596 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GIMAP5Q96F15 307 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZFP42Q96MM3 310 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TCF25Q9BQ70 676 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BTBD2Q9BX70 525 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 INTS13Q9NVM9 706 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DDIT4Q9NX09 232 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TTLL8A6PVC2 850 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PHF2O75151 1096 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CTRB1P17538 263 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CDC25AP30304 524 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RARRES1P49788 294 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NUBP1P53384 320 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CASP6P55212 293 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ANTXR2P58335 489 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PTENP60484 403 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EFEMP1Q12805 493 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LSMEM2Q8N112 164 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CYP4X1Q8N118 509 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NATD1Q8N6N6 113 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HIPK4Q8NE63 616 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SENP8Q96LD8 212 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FMO2Q99518 471 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CIDEAO60543 219 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RECQL4O94761 1208 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF23P17027 643 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NCKAP1LP55160 1127 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DYNLT1P63172 113 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DYRK1AQ13627 763 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 IMPG1Q17R60 797 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PID1Q7Z2X4 250 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OR8H3Q8N146 312 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OR4C6Q8NH72 309 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PNKPQ96T60 521 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RMND5AQ9H871 391 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 WDR41Q9HAD4 459 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC42Q9Y546 428 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LARGE1O95461 756 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms