RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	RAX	Q9Y2V3	346 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ALG6	Q9Y672	507 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CACNA1G	O43497	2377 aa		11.47	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PRSS38	A1L453	326 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CPED1	A4D0V7	1026 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	KCNK1	O00180	336 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	SPOP	O43791	374 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	SOD1	P00441	154 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	FUCA1	P04066	466 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PNLIP	P16233	465 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	LSS	P48449	732 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ZNF75D	P51815	510 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CDK3	Q00526	305 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TFDP2	Q14188	446 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PTPRR	Q15256	657 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PERM1	Q5SV97	790 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	LSMEM2	Q8N112	164 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	TRIB3	Q96RU7	358 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	APPL1	Q9UKG1	709 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	GPR34	Q9UPC5	381 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	CHKB	Q9Y259	395 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		11.46	□□□□□ -0.57
CS-223	ENST00000551137	ADAMTS20	P59510	1910 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CS	O75390	466 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	KRT1	P04264	644 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	IVL	P07476	585 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GLB1	P16278	677 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CTPS1	P17812	591 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	EPHB1	P54762	984 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SKOR1	P84550	965 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	SPA17	Q15506	151 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	QPCT	Q16769	361 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	FGF11	Q92914	225 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	COX14	Q96I36	57 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CDH19	Q9H159	772 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	RBSN	Q9H1K0	784 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	BPTF	Q12830	3046 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	MTSS1	O43312	755 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	NOBOX	O60393	691 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	BRINP1	O60477	761 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	USP12	O75317	370 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	NDUFA10	O95299	355 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ACTN2	P35609	894 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	CD86	P42081	329 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	GPR1	P46091	355 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	AP1B1	Q10567	949 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PEX6	Q13608	980 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	11.44	□□□□□ -0.58
CS-223	ENST00000551137	PPP2R5E	Q16537	467 aa		11.44	□□□□□ -0.58

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