RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 PKDCCQ504Y2 493 aa9.15□□□□□ -0.94
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THBS3-211ENST00000541990 PELI3Q8N2H9 469 aa9.15□□□□□ -0.94
THBS3-211ENST00000541990 TBCBQ99426 244 aa9.15□□□□□ -0.94
THBS3-211ENST00000541990 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
THBS3-211ENST00000541990 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
THBS3-211ENST00000541990 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.15□□□□□ -0.94
THBS3-211ENST00000541990 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.15□□□□□ -0.94
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THBS3-211ENST00000541990 SULT1C4O75897 302 aa9.15□□□□□ -0.94
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THBS3-211ENST00000541990 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
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THBS3-211ENST00000541990 RETREG3Q86VR2 466 aa9.15□□□□□ -0.94
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THBS3-211ENST00000541990 CAPN15O75808 1086 aa9.14□□□□□ -0.95
THBS3-211ENST00000541990 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
THBS3-211ENST00000541990 ELK4P28324 431 aa9.14□□□□□ -0.95
THBS3-211ENST00000541990 RCVRNP35243 200 aa9.14□□□□□ -0.95
THBS3-211ENST00000541990 IDUAP35475 653 aa9.14□□□□□ -0.95
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