RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.69□□□□□ -1.02
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THBS3-210ENST00000541576 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 A0A0U1RQS6 177 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 TTC34A8MYJ7 566 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 PRRT4C9JH25 899 aa8.69□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 TIMM44O43615 452 aa8.69□□□□□ -1.02
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THBS3-210ENST00000541576 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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THBS3-210ENST00000541576 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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THBS3-210ENST00000541576 GOT2P00505 430 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CD151P48509 253 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 PGGT1BP53609 377 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.68□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.68□□□□□ -1.02
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