RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 APCDD1Q8J025 514 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR150Q8NGU9 434 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 PIDD1Q9HB75 910 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CDH22Q9UJ99 828 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 OR51F1A6NGY5 319 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 PIGNO95427 931 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 CRTAMO95727 393 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 MPP7Q5T2T1 576 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM25Q86YD3 366 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.27■□□□□ 0.84
PACSIN3-211ENST00000539589 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 SLCO1B7G3V0H7 640 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 MATN2O00339 956 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF197O14709 1029 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 RBP1P09455 135 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 CR2P20023 1033 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 MPSTP25325 297 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 PGM1P36871 562 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJB13P59910 316 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 LMAN2Q12907 356 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 WLSQ5T9L3 541 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 AGR3Q8TD06 166 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC126Q96EE4 140 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOC2Q96KP1 924 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 LMLNQ96KR4 655 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf21Q9H246 121 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS51Q9UID3 782 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS28Q9UK41 221 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 HDAC3O15379 428 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 PIRTP0C851 137 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC166P0CW27 439 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 CD70P32970 193 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC26A3P40879 764 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 SEL1L3Q68CR1 1132 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF135Q8IUD6 432 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 RMDN1Q96DB5 314 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 UBXN10Q96LJ8 280 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 IGFLR1Q9H665 355 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.26■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 NPHS1O60500 1241 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEC1O60732 1142 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 PEX11AO75192 247 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 MT-CO1P00395 513 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 GM2AP17900 193 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 TFEBP19484 476 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINB5P36952 375 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 MXRA7P84157 204 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 ACAP2Q15057 778 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNYL1Q8N7R7 359 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 OR4L1Q8NH43 312 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 FIBINQ8TAL6 211 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 MOCOSQ96EN8 888 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 TMCC1O94876 653 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRCAPQ14761 206 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 SGF29Q96ES7 293 aa20.24■□□□□ 0.83
PACSIN3-211ENST00000539589 APOL5Q9BWW9 433 aa20.24■□□□□ 0.83
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