RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 GPD2P43304 727 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 NDST2P52849 883 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ATP6V0D1P61421 351 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 LAPTM5Q13571 262 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 KYQ8NBH2 561 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PMEPA1Q969W9 287 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 MARK4Q96L34 752 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 C12orf66Q96MD2 445 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 RIBC2Q9H4K1 309 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 SAC3D1A6NKF1 404 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 OR6B1O95007 311 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PIGNO95427 931 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 PRAMEF1O95521 474 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 TSPAN8P19075 237 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 LDLRAP1Q5SW96 308 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 MBLAC2Q68D91 279 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 KRT77Q7Z794 578 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 DHFR2Q86XF0 187 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 WDR26Q9H7D7 661 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRB-204ENST00000538708 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 MFSD11O43934 449 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SLC35G6P0C7Q6 338 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CSF2RAP15509 400 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 GSTM5P46439 218 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SLC11A1P49279 550 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 AP1S1P61966 158 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM192Q8IY95 271 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ITFG1Q8TB96 612 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 P2RY11Q96G91 374 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 FBXL18Q96ME1 805 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CDADC1Q9BWV3 514 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 KLC4Q9NSK0 619 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 RGS5O15539 181 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TGFB1I1O43294 461 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 OR1F1O43749 312 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CALB2P22676 271 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ENPP3O14638 875 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 MYL12AP19105 171 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 MYBPC1Q00872 1141 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TSNQ15631 228 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 C5orf34Q96MH7 638 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CPXM1Q96SM3 734 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 AP3D1O14617 1153 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 KLRC4O43908 158 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PEX1O43933 1283 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00032P0C843 101 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 MAGEA9P43362 315 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 DGKKQ5KSL6 1271 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SUSD3Q96L08 255 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 OR2AG1Q9H205 316 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 VPS45Q9NRW7 570 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 NDST3O95803 873 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CCNCP24863 283 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SEC24CP53992 1094 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TAS2R40P59535 323 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 DSG1Q02413 1049 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 DUPD1Q68J44 220 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ANO7Q6IWH7 933 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms