RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDK3	Q00526	305 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	DPT	Q07507	201 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTP5	Q14D33	572 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR0B2	Q15466	257 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	QPCT	Q16769	361 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFX6	Q8HWS3	928 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	KY	Q8NBH2	561 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	EID2B	Q96D98	161 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGAP2	Q99490	1192 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD84	Q9UIB8	345 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAX	Q9Y2V3	346 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS38	A1L453	326 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPED1	A4D0V7	1026 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLDN7	O95471	211 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNF	P01375	233 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDX1	P52945	283 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP1B1	Q10567	949 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	WASHC5	Q12768	1159 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGEF7	Q14155	803 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDK1	Q15118	436 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELOC	Q15369	112 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NLRP8	Q86W28	1048 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NRROS	Q86YC3	692 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR156	Q8NFN8	814 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCAMP4	Q969E2	229 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		12.68	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0U1RQJ8	604 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOBOX	O60393	691 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CST8	O60676	142 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTSE	P14091	401 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF30	P17039	623 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPN3	P26045	913 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLD2	P49005	469 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPA17	Q15506	151 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEX44	Q53QW1	395 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARL10	Q8N8L6	244 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATL2	Q8NHH9	583 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAPK15	Q8TD08	544 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	COX14	Q96I36	57 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGAP3	Q96P47	875 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PADI4	Q9UM07	663 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR34	Q9UPC5	381 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	BPTF	Q12830	3046 aa		12.67	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAMTS20	P59510	1910 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PJA2	O43164	708 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CS	O75390	466 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	KEL	P23276	732 aa		12.66	□□□□□ -0.38

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