RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	NF1	P21359	2839 aa		13.21	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CBX6	O95503	412 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ACTR1B	P42025	376 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CCL11	P51671	97 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ACTR1A	P61163	376 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	FOXM1	Q08050	763 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	GRM3	Q14832	879 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CPZ	Q66K79	652 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	C19orf60	Q96EN9	201 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	NEU3	Q9UQ49	428 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		13.2	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM72C	H0Y354	149 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT86	O43790	486 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	LRCH4	O75427	683 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	KIAA0754	O94854	1291 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CASP14	P31944	242 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	FLT3	P36888	993 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	POLD2	P49005	469 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	DNASE1L3	Q13609	305 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ACOX1	Q15067	660 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CYTH1	Q15438	398 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	GJB7	Q6PEY0	223 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	TEX101	Q9BY14	249 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		13.19	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276		A8MX80	341 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	DPM1	O60762	260 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	LRIG2	O94898	1065 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	MAP3K6	O95382	1288 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	NFKBIA	P25963	317 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CDK3	Q00526	305 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC6A19	Q695T7	634 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	DPPA4	Q7L190	304 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CEP63	Q96MT8	703 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ING2	Q9H160	280 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.18	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	NDUFA10	O95299	355 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	IVL	P07476	585 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ADRA1B	P35368	520 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT9	P35527	623 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	SCNN1A	P37088	669 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	MAPK9	P45984	424 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP11A	P98196	1134 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	HHEX	Q03014	270 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	PNOC	Q13519	176 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	CT55	Q8WUE5	264 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	THAP4	Q8WY91	577 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	NUS1	Q96E22	293 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	COQ10A	Q96MF6	247 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	RANBP9	Q96S59	729 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ACTL8	Q9H568	366 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	PADI1	Q9ULC6	663 aa		13.17	□□□□□ -0.3
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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