RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 NHSL2Q5HYW2 709 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 ARTNQ5T4W7 220 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 IL23RQ5VWK5 629 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 REP15Q6BDI9 236 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 NEPROQ6NW34 567 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 TAPT1Q6NXT6 567 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 CES3Q6UWW8 571 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 CLEC20AQ6ZU45 233 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 EEPD1Q7L9B9 569 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 ZNF554Q86TJ5 538 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 AADATQ8N5Z0 425 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 SEPT8Q92599 483 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 BORCS5Q969J3 196 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 RDH12Q96NR8 316 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 WDCPQ9H6R7 721 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 PREBQ9HCU5 417 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 TREX1Q9NSU2 369 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 PIGVQ9NUD9 493 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 TBC1D23Q9NUY8 699 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 SEPT3Q9UH03 358 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 APPL1Q9UKG1 709 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 NME7Q9Y5B8 376 aa9.4□□□□□ -0.9
HULC-201ENST00000503668 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.4□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 A0A0J9YVX5 310 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 A0A1B0GVG6 124 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 WASH4PA8MWX3 477 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 E7ENX8 843 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 H3BSA7 217 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 NOL3O60936 208 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 JCHAINP01591 159 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 PDGFRBP09619 1106 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 CPB1P15086 417 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 ATP6V1B1P15313 513 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 YY1P25490 414 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 ERFP50548 548 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 LILRA4P59901 499 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 EPS8Q12929 822 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 MTA1Q13330 715 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 DLG2Q15700 870 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 MTX3Q5HYI7 312 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 RANBP10Q6VN20 620 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 Q6ZNX1 250 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 SPRED1Q7Z699 444 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 CUZD1Q86UP6 607 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 TRPV3Q8NET8 790 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 NXNL1Q96CM4 212 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 NRBF2Q96F24 287 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 MAGED4Q96JG8 741 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 ELMO2Q96JJ3 720 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 MED10Q9BTT4 135 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 POMKQ9H5K3 350 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 CAB39LQ9H9S4 337 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 FAIMQ9NVQ4 179 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.39□□□□□ -0.91
HULC-201ENST00000503668 OR12D3Q9UGF7 316 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms