RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495619.1

NCKAP1-208, Transcript of NCK associated protein 1, human

TSL 3

Gene NCKAP1, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A0B4J293	547 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	IGLV2-11	P01706	119 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	CYC1	P08574	325 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	CETP	P11597	493 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	KCNA5	P22460	613 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	FOXM1	Q08050	763 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZBTB17	Q13105	803 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	RND1	Q92730	232 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	FKRP	Q9H9S5	495 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	PREB	Q9HCU5	417 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NCKAP1-208	ENST00000495619		A6NLC8	198 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	TNFSF14	O43557	240 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	SEC14L2	O76054	403 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	KRT10	P13645	584 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF132	P52740	706 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	OLIG2	Q13516	323 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCNG2	Q16589	344 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	CDC73	Q6P1J9	531 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	NR4A3	Q92570	626 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	GTF3C6	Q969F1	213 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	TMEM68	Q96MH6	324 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	C1RL	Q9NZP8	487 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A1W2PQM1	296 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619		A0A1W2PS18	150 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	LMX1B	O60663	402 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	CRYAA	P02489	173 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	DDIT3	P35638	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	GRIK2	Q13002	908 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	FGFBP1	Q14512	234 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	KMT5C	Q86Y97	462 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	UHRF2	Q96PU4	802 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	NODAL	Q96S42	347 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	TINAG	Q9UJW2	476 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	PADI1	Q9ULC6	663 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	CCDC189	A1A4V9	331 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	FAM172BP	A6NC97	362 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	C16orf97	H3BN30	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	LDLRAD4	O15165	306 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	SPINT2	O43291	252 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	ANOS1	P23352	680 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	FASLG	P48023	281 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	TUB	P50607	506 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	PHEX	P78562	749 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	FRG2	Q64ET8	278 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	TTI2	Q6NXR4	508 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	TSSK4	Q6SA08	328 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	TTC14	Q96N46	770 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NCKAP1-208	ENST00000495619	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58

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