RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494672.1

CCDC66-222, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 577 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-222	ENST00000494672	TPM4	P67936	248 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CCNA1	P78396	465 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	IL1RL1	Q01638	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ACY1	Q03154	408 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	DDR1	Q08345	913 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	KEAP1	Q14145	624 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	GNA13	Q14344	377 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	KLC3	Q6P597	504 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672		Q6ZTK2	550 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SHC3	Q92529	594 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SGK3	Q96BR1	496 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ART5	Q96L15	291 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	PANK3	Q9H999	370 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672		M0QYT0	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	MAPK13	O15264	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	STRN	O43815	780 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	NEURL1	O76050	574 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	OR5F1	O95221	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CD4	P01730	458 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ARSB	P15848	533 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CYP3A7	P24462	503 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	MT3	P25713	68 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CETN2	P41208	172 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	STAT1	P42224	750 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ADPRH	P54922	357 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	OLR1	P78380	273 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	MPP1	Q00013	466 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CUL3	Q13618	768 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	PPA1	Q15181	289 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	NCLN	Q969V3	563 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CCDC66-222	ENST00000494672	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65

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