RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 KIAA1024LP59773 190 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 DAB2P98082 770 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 HS1BP3Q53T59 392 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 CCDC181Q5TID7 509 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 PEX26Q7Z412 305 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 OR1E3Q8WZA6 343 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 SCAMP4Q969E2 229 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 APOLD1Q96LR9 279 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 TEKT5Q96M29 485 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 WDR92Q96MX6 357 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 CLPBQ9H078 707 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 WDR26Q9H7D7 661 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 GLOD4Q9HC38 313 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 FGF22Q9HCT0 170 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 UBP1Q9NZI7 540 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 SPASTQ9UBP0 616 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 KLQ9UEF7 1012 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 AMFRQ9UKV5 643 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 RP1P56715 2156 aa7.5□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 H7C0C1 242 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 YY2O15391 372 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 PMPCBO75439 489 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 SOD1P00441 154 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 TNFP01375 233 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ANXA6P08133 673 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 CKMT1AP12532 417 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 CTSEP14091 401 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ZNF30P17039 623 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 NFKB1P19838 968 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ACP1P24666 158 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 RBL1P28749 1068 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 GPR1P46091 355 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ATP5OP48047 213 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 BLKP51451 505 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 STC1P52823 247 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 COPS2P61201 443 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 CDK3Q00526 305 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 CDK18Q07002 472 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 NOMO1Q15155 1222 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 CDKN3Q16667 212 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 PID1Q7Z2X4 250 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ZNF567Q8N184 647 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 OR56A4Q8NGH8 313 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ATL2Q8NHH9 583 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ACTL9Q8TC94 416 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 HTR3CQ8WXA8 447 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 GATA6Q92908 595 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 TADA1Q96BN2 335 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 AP2M1Q96CW1 435 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 TRIB3Q96RU7 358 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 LYSMD1Q96S90 227 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 AGAP2Q99490 1192 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 TEX101Q9BY14 249 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ADGRE3Q9BY15 652 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 ABCG8Q9H221 673 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PATJ-211ENST00000493967 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms