RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 OGG1O15527 345 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 EPN2O95208 641 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 APOA4P06727 396 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 ARSBP15848 533 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 ME1P48163 572 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 ENTPD1P49961 510 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 CDC16Q13042 620 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 TNFAIP1Q13829 316 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.8□□□□□ -1.16
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PTPRC-212ENST00000491302 MTSS1LQ765P7 747 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 DPPA4Q7L190 304 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 KBTBD6Q86V97 674 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 MMP21Q8N119 569 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 GPT2Q8TD30 523 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 RADILQ96JH8 1075 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 ACOX2Q99424 681 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 SH3GL2Q99962 352 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM51Q9NW97 253 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.8□□□□□ -1.16
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PTPRC-212ENST00000491302 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
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PTPRC-212ENST00000491302 C1orf226A1L170 272 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 WNT9BO14905 357 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 TUBBP07437 444 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 KCNC3Q14003 757 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.79□□□□□ -1.16
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PTPRC-212ENST00000491302 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 MCUQ8NE86 351 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 OR8K5Q8NH50 307 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 TRIB2Q92519 343 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 ERGIC1Q969X5 290 aa7.79□□□□□ -1.16
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PTPRC-212ENST00000491302 GCNAQ96QF7 691 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
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PTPRC-212ENST00000491302 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF711Q9Y462 761 aa7.79□□□□□ -1.16
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PTPRC-212ENST00000491302 GRIK2Q13002 908 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 MTX3Q5HYI7 312 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 KRT79Q5XKE5 535 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 ARRDC2Q8TBH0 407 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 INPP5DQ92835 1189 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRC-212ENST00000491302 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF804BA4D1E1 1349 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-212ENST00000491302 CGB1A6NKQ9 187 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 H7C0S8 307 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 ITM2AO43736 263 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 FTCDO95954 541 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 CYP1A2P05177 515 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 LIG4P49917 911 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 LAMB3Q13751 1172 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 GPR18Q14330 331 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 PTGR1Q14914 329 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 MMEL1Q495T6 779 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF626Q68DY1 528 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC17AQ6ZS10 378 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 SHFQ7M4L6 423 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 PIP4P1Q86T03 277 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 TRPC4APQ8TEL6 797 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.77□□□□□ -1.17
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