RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALBP02768 609 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT1P04264 644 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 S100A6P06703 90 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PROS1P07225 676 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MSH3P20585 1137 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGXTP21549 392 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MPSTP25325 297 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GRK3P35626 688 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 HMGCLP35914 325 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEMA3AQ14563 771 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 IRF3Q14653 427 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CA9Q16790 459 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 BTBD16Q32M84 506 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PNCKQ6P2M8 343 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DHFR2Q86XF0 187 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR48Q8TAF3 677 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAR1Q8WVX9 515 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOXJ1Q92949 421 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 HDAC10Q969S8 669 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TEKT5Q96M29 485 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DMAC2Q9NW81 257 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MEIOCA2RUB1 952 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRSS44E7EML9 344 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHRNGP07510 517 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACADMP11310 421 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD53P19397 219 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TGM2P21980 687 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACVR2AP27037 513 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GP5P40197 560 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYL6P60660 151 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MEP1AQ16819 746 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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CACNA2D3-210ENST00000490478 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LGSNQ5TDP6 509 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNTD1Q8N815 330 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 BEST2Q8NFU1 509 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 YIPF6Q96EC8 236 aa6.89□□□□□ -1.31
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CACNA2D3-210ENST00000490478 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLHL15Q96M94 604 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 C12orf57Q99622 126 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 STRA6Q9BX79 667 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ING2Q9H160 280 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFT46Q9NQC8 304 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLI3P10071 1580 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 C2orf81A6NN90 581 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 KPNA6O60684 536 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 HSPA4LO95757 839 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCNE2O96020 404 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADORA3P0DMS8 318 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARSAP15289 507 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ITGA2P17301 1181 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 VAMP1P23763 118 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 IL12RB1P42701 662 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RFX2P48378 723 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 BLVRAP53004 296 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACOX1Q15067 660 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 UGP2Q16851 508 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNS4Q8IZW8 715 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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