RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 PSMB9P28065 219 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ZNF697Q5TEC3 545 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CDC73Q6P1J9 531 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DAW1Q8N136 415 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 NIPA2Q8N8Q9 360 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 KREMEN2Q8NCW0 462 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TMEM175Q9BSA9 504 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 BTRCQ9Y297 605 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 A0A087WXM4 84 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 BBIP1A8MTZ0 92 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DHX15O43143 795 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CDK14O94921 469 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 UMPSP11172 480 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 LMO2P25791 158 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CMC1Q7Z7K0 106 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB2Q8N680 514 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 RORBQ92753 470 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 NTAN1Q96AB6 310 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 NACC2Q96BF6 587 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 H3BM21 787 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TTC23Q5W5X9 447 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 LUZP2Q86TE4 346 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 EPHX4Q8IUS5 362 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 NETO2Q8NC67 525 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TEKT5Q96M29 485 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 FAM83DQ9H4H8 585 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 VNN1O95497 513 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 IDSP22304 550 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 GRB14Q14449 540 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TIGD5Q53EQ6 642 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CRTC3Q6UUV7 619 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ZNF567Q8N184 647 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 LEMD2Q8NC56 503 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SIX2Q9NPC8 291 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 PCDH12Q9NPG4 1184 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PPM1 405 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 GSAPA4D1B5 854 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 C8AP07357 584 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CCL14Q16627 93 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ARMCX4Q5H9R4 360 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CUZD1Q86UP6 607 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 AIF1LQ9BQI0 150 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 HEPHQ9BQS7 1158 aa17.03■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 IPO13O94829 963 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CCR4P51679 360 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DSC2Q02487 901 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 C16orf62Q7Z3J2 963 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 GATAD2AQ86YP4 633 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 C7orf61Q8IZ16 206 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CRYBG2Q8N1P7 616 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 FBXO30Q8TB52 745 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC11Q9NVH1 559 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 EPHX1P07099 455 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 FECHP22830 423 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CAP1Q01518 475 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SOWAHAQ2M3V2 549 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ALG11Q2TAA5 492 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ULK2Q8IYT8 1036 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CCDC159P0C7I6 412 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SPIRE1Q08AE8 756 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 VN1R5Q7Z5H4 357 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SLC22A17Q8WUG5 538 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 DEPDC7Q96QD5 511 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 PANX1Q96RD7 426 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 LRMDAQ9H2I8 198 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A3Q00325 362 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 LPCAT2Q7L5N7 544 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 MTERF3Q96E29 417 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 SUSD3Q96L08 255 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 FBXL18Q96ME1 805 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 CAB39LQ9H9S4 337 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 CHRAC1Q9NRG0 131 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 TLR6Q9Y2C9 796 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 SERPINB7O75635 380 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 NR2F1P10589 423 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 GPD2P43304 727 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 BIKQ13323 160 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ZNF618Q5T7W0 954 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ADGRD1Q6QNK2 874 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 GCNT7Q6ZNI0 430 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 FGD2Q7Z6J4 655 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 GPR156Q8NFN8 814 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 HMCESQ96FZ2 354 aa17.02■□□□□ 0.31
NISCH-213ENST00000489895 ADI1Q9BV57 179 aa17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms