RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	POLQ	O75417	2590 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	F9	P00740	461 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	GNLY	P22749	145 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	MPST	P25325	297 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ETFB	P38117	255 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	LIMK2	P53671	638 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	RAD51	Q06609	339 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ELP6	Q0PNE2	266 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	MTM1	Q13496	603 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	NETO2	Q8NC67	525 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	THAP2	Q9H0W7	228 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	EFCAB7	A8K855	629 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344		K7EM74	188 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ABCB7	O75027	752 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	VPS4B	O75351	444 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CYP1A2	P05177	515 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	GPD1	P21695	349 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CD1C	P29017	333 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SDC4	P31431	198 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	KIAA1024L	P59773	190 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	BIRC2	Q13490	618 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ANKS6	Q68DC2	871 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM51	Q9NW97	253 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	DKK3	Q9UBP4	350 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	VPS4A	Q9UN37	437 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	INSIG1	O15503	277 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ZW10	O43264	779 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	TMCC1	O94876	653 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	PIGN	O95427	931 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	LCA5L	O95447	670 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	IGSF6	O95976	241 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	RNF224	P0DH78	156 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	MAGEA1	P43355	309 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	PTPN9	P43378	593 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	LIG3	P49916	1009 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	ATP11A	P98196	1134 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM3-208	ENST00000489344	SPA17	Q15506	151 aa		13.84	□□□□□ -0.19

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